2008年起，慈济与联合国难民署合作创办难民孩童教育中心，志工每月定期至教育中心落实慈济人文教育。 2016年由于学生人数招收减少，合心难民学校和协力难民学校地理位置接近，因此合并于合心难民学校授课，集中管理资源，另一所则是和气难民学校。期间有十六位退休校长（亦是慈济志工）加入协理及监督校务运作，逐步将学习中心转型成正规学校。